因为家人工作的原因，原本生活在繁华大都市的鹤木阳渚（高尾奏音 配音）搬到了风景秀美的乡下，并且进入了那里的学校就读。并不适应室外作业的阳渚本想加入学校的手工社团，哪知道在误打误撞之下遇见了名为黑岩悠希（筱原侑 配音）的前辈，在前辈的威逼利诱之下，阳渚最终加入了悠希所在的海堤社。个性大大咧咧，运动神经极为发达的帆高夏海（川井田夏海 配音）、性格沉稳，尤其擅长烹饪的大野真（明坂聪美 配音），再加上一个非常习惯恶搞社员，思维过于活跃和跳跃的社长悠希，阳渚充满了欢笑和汗水的课后部活就此拉开了序幕。
在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。 此作的世界观与TYPE-MOON多作共通的世界观基本设定一致，但却是从TYPE-MOON多作共通世界观的1970年代派生出来的平行世界，而并不单纯是月姬和Fate等作品的未来。 在这个世界中大源的魔力(Mana)已经枯竭了。因此TYPE-MOON多作共通的世界观中的“魔术(Magi)”和“魔术师(Magus)”几乎都衰落了，魔术协会也只余下本来就不太依赖魔力的“阿特拉斯院”。
阿凡无意间干扰了时光特警队出任务，现在得和队员莉姆一起回到过去，穿梭各个时空拯救无辜性命，也亲眼见证历史往前推进。
到处旅行靠贩卖一些小商品为生的商人罗伦斯，从因为收获祭而沸腾的帕斯罗村回来后，发现貌似有什么东西在自己的运货马车里。罗伦斯把麦束拨开一看，发现里面睡着一只长有狼耳和狼尾巴的少女。这位少女自称是“掌控丰
“阿黄”和“阿红”是两只臭屁虫，住在一幢被摩天大楼包围着的老房子里。对他们俩而言，人类留下的廉价食物给他们带来了厨房体验，老房子里的老物什更是他们完美的玩物。他们互相打闹，争抢着那些人类不需要的东西，也一起被老屋中的宠物狗或者鹦鹉追赶。暴躁的“阿红”和贪吃的“阿黄”日复一日地上演着滑稽搞笑的生存游戏。
小时候看过夏依妮·莎莉温的魔法表演后，梦想成为魔女的阿科，进入了与莎莉温相同的传统魔女育成名门校“露娜诺娃魔法学校”。 新的城镇，新的学校生活，以及新遇到的朋友。魔女学校中的扫帚飞行课程以及充满魔法气息的不可思议的授课等等，在这些只有魔女学校中才有的课程当中，阿科与萝特、苏西等人引发了大骚动！ 将露娜诺娃卷入其中，阿科成为魔女的第一步就此开始——
